Como funciona
Da amostra à informação.
Entre uma pergunta sobre biodiversidade e uma informação para o projeto, existe uma sequência de escolhas. O desenho do estudo orienta a amostragem, a abordagem molecular e a interpretação.
UM PERCURSO, DIFERENTES ABORDAGENS
Explore cada etapa.
Selecione uma etapa para entender o que acontece e o que orienta as escolhas. O percurso é ajustado à pergunta e ao escopo do estudo.
01PerguntaTudo começa com uma pergunta.
- O que acontece nesta etapa
- O objetivo do estudo orienta toda a escolha metodológica. É necessário definir o que se deseja detectar, comparar ou compreender.
- O que precisa estar definido
- A precisão necessária, a escala espacial e o contexto da decisão influenciam o desenho. Comparações entre locais ou campanhas precisam de planejamento compatível.
- O que a MetaGen avalia ou executa
- Discute as possibilidades e os limites das abordagens a partir da pergunta e do escopo do estudo, antes da coleta.
O ambiente e a pergunta orientam o desenho amostral. 02AmostraPreservar o material. Registrar o contexto.
- O que acontece nesta etapa
- Água, solo, sedimento ou tecido podem carregar a informação necessária. A escolha da matriz acompanha a abordagem: nem toda análise é adequada a todos os tipos de amostra.
- O que precisa estar definido
- Tipo de amostra, locais, replicação, conservação e metadados são definidos conforme o escopo e o desenho do estudo. A rastreabilidade da identificação da amostra deve ser preservada.
- O que a MetaGen avalia ou executa
- Alinha os requisitos da amostragem à análise prevista e considera os registros e as condições do material recebido na interpretação. A realização da coleta e as responsabilidades são definidas no escopo.
Filtragem de água. Outras matrizes exigem procedimentos próprios. 03ExtraçãoDa amostra ao material genético.
- O que acontece nesta etapa
- O DNA é isolado da amostra em ambiente controlado. Controles ajudam a identificar possíveis contaminações.
- O que precisa estar definido
- A matriz e as condições de preservação orientam os procedimentos. Quantidade e qualidade do material podem influenciar as etapas seguintes.
- O que a MetaGen avalia ou executa
- Avalia o material e executa a preparação do DNA e os controles definidos conforme a matriz e o escopo, sem uma sequência única aplicável a todos os estudos.
04Análise molecularA abordagem acompanha o objetivo.
- O que acontece nesta etapa
- A pergunta pode conduzir a diferentes linhas moleculares. Nenhuma técnica é universalmente superior: cada abordagem tem possibilidades e limites.
- O que precisa estar definido
- Organismos de interesse, matriz, marcadores ou alvos e informação necessária orientam a escolha, conforme o desenho e o escopo.
- O que a MetaGen avalia ou executa
- Avalia a adequação da abordagem e executa as análises previstas. As quatro linhas abaixo seguem para o processamento dos dados e a interpretação.
Quatro linhas, uma base comum
- DNA ambiental (eDNA) e metabarcoding
Investigação de conjuntos de organismos conforme a matriz, os marcadores e as referências.
- qPCR
Detecção de um alvo definido e quantificação quando aplicável ao escopo.
- DNA barcoding
Identificação molecular de espécimes por comparação com referências.
- Genética e genômica de populações
Perguntas sobre diversidade, estrutura e conectividade.
Todas seguem para 05 / Dados e 06 / Informação. A bioinformática participa do processamento dos dados, conforme a abordagem.
05DadosDados precisam de contexto.
- O que acontece nesta etapa
- Os dados moleculares são processados de acordo com a abordagem. Quando há sequenciamento, passam por etapas bioinformáticas. Nem toda análise molecular inclui sequenciamento.
- O que precisa estar definido
- Bases de referência, filtros, parâmetros e controles influenciam a interpretação. A qualidade e o registro dos dados precisam acompanhar o processamento.
- O que a MetaGen avalia ou executa
- Organiza os dados e aplica os critérios analíticos pertinentes, registrando etapas e parâmetros. A bioinformática integra o processamento de sequências e, quando cabível, a atribuição taxonômica.
06InformaçãoO resultado volta à pergunta.
- O que acontece nesta etapa
- O resultado precisa responder à pergunta original. Métodos, critérios e limitações permanecem explícitos, junto aos demais dados do estudo.
- O que precisa estar definido
- Formato da informação e nível de interpretação são definidos conforme o escopo e o desenho do estudo.
- O que a MetaGen avalia ou executa
- Interpreta e organiza as evidências dentro do escopo combinado. Detectar DNA não permite inferir automaticamente abundância, tamanho populacional ou presença de indivíduo vivo; essas inferências exigem suporte da abordagem específica. Não detecção não comprova ausência absoluta.
Para aprofundar em DNA ambiental
Referências de apoio à abordagem de eDNA, sem relação com resultados ou projetos da MetaGen.
CONVERSE COM A METAGEN
Da pergunta ao desenho do estudo.
Conte o objetivo do projeto para conversarmos sobre a abordagem molecular e o escopo da análise.