Cómo funciona

De la muestra a la información.

Entre una pregunta sobre biodiversidad y la información para el proyecto existe una secuencia de decisiones. El diseño del estudio orienta el muestreo, el enfoque molecular y la interpretación.

UN RECORRIDO, DIFERENTES ENFOQUES

Explore cada etapa.

Seleccione una etapa para entender qué ocurre y qué orienta las decisiones. El recorrido se ajusta a la pregunta y al alcance del estudio.

  1. 01PreguntaTodo comienza con una pregunta.
    Qué ocurre en esta etapa
    El objetivo del estudio orienta todas las decisiones metodológicas. Es necesario definir qué se desea detectar, comparar o comprender.
    Qué debe estar definido
    La precisión necesaria, la escala espacial y el contexto de la decisión influyen en el diseño. Las comparaciones entre lugares o campañas requieren una planificación compatible.
    Qué evalúa o realiza MetaGen
    Discute las posibilidades y los límites de los enfoques a partir de la pregunta y del alcance del estudio, antes del muestreo.
    Pequeño curso de agua entre rocas y vegetación de bosque.
    El ambiente y la pregunta orientan el diseño de muestreo.
  2. 02MuestraPreservar el material. Registrar el contexto.
    Qué ocurre en esta etapa
    El agua, el suelo, el sedimento o el tejido pueden contener la información necesaria. La elección del tipo de muestra responde al enfoque: no todos los análisis son adecuados para todos los tipos de muestra.
    Qué debe estar definido
    El tipo de muestra, los lugares, la replicación, la preservación y los metadatos se definen según el alcance y el diseño del estudio. Debe preservarse la trazabilidad de la identificación de la muestra.
    Qué evalúa o realiza MetaGen
    Alinea los requisitos del muestreo con el análisis previsto y considera los registros y las condiciones del material recibido al interpretar los resultados. La realización del muestreo y las responsabilidades se definen en el alcance.
    Manos con guantes utilizando una jeringa y un filtro para filtrar agua.
    Filtración de agua. Otros tipos de muestra requieren procedimientos propios.
  3. 03ExtracciónDe la muestra al material genético.
    Qué ocurre en esta etapa
    El ADN se aísla de la muestra en un ambiente controlado. Los controles ayudan a identificar posibles contaminaciones.
    Qué debe estar definido
    El tipo de muestra y las condiciones de preservación orientan los procedimientos. La cantidad y la calidad del material pueden influir en las etapas siguientes.
    Qué evalúa o realiza MetaGen
    Evalúa el material y realiza la preparación del ADN y los controles definidos según el tipo de muestra y el alcance, sin una secuencia única aplicable a todos los estudios.
  4. 04Análisis molecularEl enfoque responde al objetivo.
    Qué ocurre en esta etapa
    La pregunta puede conducir a diferentes líneas moleculares. Ninguna técnica es universalmente superior: cada enfoque tiene posibilidades y límites.
    Qué debe estar definido
    Los organismos de interés, el tipo de muestra, los marcadores u objetivos y la información necesaria orientan la elección, según el diseño y el alcance.
    Qué evalúa o realiza MetaGen
    Evalúa la adecuación del enfoque y realiza los análisis previstos. Las cuatro líneas siguientes continúan hacia el procesamiento de los datos y la interpretación.

    Cuatro líneas, una base común

    Conozca el metabarcoding

    Todas continúan hacia 05 / Datos y 06 / Información. La bioinformática participa en el procesamiento de los datos según el enfoque.

  5. 05DatosLos datos necesitan contexto.
    Qué ocurre en esta etapa
    Los datos moleculares se procesan de acuerdo con el enfoque. Cuando hay secuenciación, pasan por etapas bioinformáticas. No todos los análisis moleculares incluyen secuenciación.
    Qué debe estar definido
    Las bases de datos de referencia, los filtros, los parámetros y los controles influyen en la interpretación. La calidad y el registro de los datos deben acompañar el procesamiento.
    Qué evalúa o realiza MetaGen
    Organiza los datos y aplica los criterios analíticos pertinentes, registrando las etapas y los parámetros. La bioinformática integra el procesamiento de secuencias y, cuando corresponde, la asignación taxonómica.
    Conozca la bioinformática
  6. 06InformaciónEl resultado vuelve a la pregunta.
    Qué ocurre en esta etapa
    El resultado debe responder a la pregunta original. Los métodos, los criterios y las limitaciones permanecen explícitos, junto con los demás datos del estudio.
    Qué debe estar definido
    El formato de la información y el nivel de interpretación se definen según el alcance y el diseño del estudio.
    Qué evalúa o realiza MetaGen
    Interpreta y organiza las evidencias dentro del alcance acordado. Detectar ADN no permite inferir automáticamente la abundancia, el tamaño poblacional ni la presencia de un individuo vivo; estas inferencias requieren respaldo del enfoque específico. La no detección no demuestra una ausencia absoluta.
    Consideraciones para la interpretación del eDNA
Ver ejemplos de aplicación

Para profundizar en ADN ambiental

Referencias de apoyo al enfoque de eDNA, sin relación con resultados ni proyectos de MetaGen.

HABLE CON METAGEN

De la pregunta al diseño del estudio.

Cuéntenos el objetivo del proyecto para conversar sobre el enfoque molecular y el alcance del análisis.