Genômica ambiental para a biodiversidade, do desenho do estudo à interpretação dos dados. As linhas de serviço se complementam conforme o objetivo do projeto.
Investigar a biodiversidade a partir dos vestígios de DNA presentes no ambiente.
A abordagem conecta amostragem, análise molecular e bioinformática. O metabarcoding pode integrar esse percurso para investigar conjuntos de organismos.
Conheça a abordagem
Análise de regiões do DNA em uma mistura de material biológico para investigar diferentes organismos. Pode ser aplicada a DNA ambiental e a amostras comunitárias, como ictioplâncton e invertebrados, conforme os grupos de interesse.
Os marcadores e as referências disponíveis delimitam o que pode ser identificado.
Conheça Metabarcoding ↗
Detecção e quantificação de espécies-alvo, quando aplicável ao escopo da análise.
Abordagem direcionada a uma espécie ou alvo previamente definido.
Conheça qPCR ↗
Identificação molecular de uma amostra biológica por comparação de regiões do DNA com sequências de referência.
A identificação depende da qualidade da amostra, do marcador e da representação do grupo nas bases de referência.
Conheça DNA barcoding ↗
Investigação da diversidade e da estrutura genética entre indivíduos e populações, apoiando perguntas sobre conservação e conectividade.
Microssatélites, SNPs e sequenciamento são possibilidades cuja escolha depende da pergunta, dos indivíduos e das localidades amostradas.
Conheça Genética e genômica de populações ↗
Processamento de dados de sequenciamento, avaliação de qualidade e organização de resultados para interpretação biológica.
Critérios analíticos, bases de referência e limites de atribuição taxonômica fazem parte do escopo.
Conheça Bioinformática ↗Aplicações possíveis: a pergunta, a amostra e os limites da abordagem orientam o escopo e as entregas.
Grupos, matrizes e entregas dependem do desenho, dos marcadores e das referências disponíveis. Não detectar DNA não comprova ausência da espécie.
Conheça a abordagem Entenda o metabarcoding
A espécie ameaçada Y ainda persiste no trecho após a obra?
Presença/ausência refere-se à detecção do alvo nas condições do ensaio. Não detecção não equivale a ausência absoluta; a disponibilidade e a validação do ensaio devem ser avaliadas.
Conheça a abordagem
A identificação morfológica está correta?
O nível de identificação possível depende da qualidade da amostra, do marcador e das referências disponíveis.
Conheça a abordagem
Qual a diversidade genética da população-fonte para uma reintrodução?
A conectividade genética não mede diretamente o deslocamento atual de indivíduos. Inferências dependem da escala temporal, da amostragem e dos marcadores; uma associação não demonstra causalidade por si só.
Conheça a abordagem
Escopo, curadoria e controles dependem dos dados e metadados disponíveis. A resolução taxonômica acompanha a qualidade das sequências e das referências.
Conheça a abordagemConte o contexto do projeto, o ambiente e a pergunta que precisa responder. A conversa inicial ajuda a definir a abordagem e o escopo.