Genómica ambiental para la biodiversidad, desde el diseño del estudio hasta la interpretación de los datos. Las líneas de servicio se complementan según el objetivo del proyecto.
Investigar la biodiversidad a partir de rastros de ADN presentes en el ambiente.
El enfoque conecta el muestreo, el análisis molecular y la bioinformática. El metabarcoding puede formar parte de este recorrido para investigar conjuntos de organismos.
Conozca el enfoque
Análisis de regiones del ADN en una mezcla de material biológico para investigar diferentes organismos. Puede aplicarse al ADN ambiental y a muestras de comunidades, como ictioplancton e invertebrados, según los grupos de interés.
Los marcadores y las referencias disponibles delimitan lo que puede identificarse.
Conozca Metabarcoding ↗
Detección y cuantificación de especies objetivo, cuando sea aplicable al alcance del análisis.
Enfoque dirigido a una especie u objetivo previamente definido.
Conozca qPCR ↗
Identificación molecular de una muestra biológica mediante la comparación de regiones del ADN con secuencias de referencia.
La identificación depende de la calidad de la muestra, del marcador y de la representación del grupo en las bases de datos de referencia.
Conozca DNA barcoding ↗
Investigación de la diversidad y la estructura genética entre individuos y poblaciones, que aporta información para preguntas sobre conservación y conectividad.
Los microsatélites, los SNPs y la secuenciación son opciones cuya elección depende de la pregunta, de los individuos y de las localidades muestreadas.
Conozca Genética y genómica de poblaciones ↗
Procesamiento de datos de secuenciación, evaluación de la calidad y organización de los resultados para su interpretación biológica.
Los criterios analíticos, las bases de datos de referencia y los límites de la asignación taxonómica forman parte del alcance.
Conozca Bioinformática ↗Aplicaciones posibles: la pregunta, la muestra y los límites del enfoque orientan el alcance y las entregas.
Los grupos, los tipos de muestra y las entregas dependen del diseño, los marcadores y las referencias disponibles. No detectar ADN no demuestra la ausencia de la especie.
Conozca el enfoque Comprenda el metabarcoding
¿La especie amenazada Y aún persiste en el tramo después de la obra?
La presencia o ausencia se refiere a la detección del objetivo en las condiciones del ensayo. La no detección no equivale a una ausencia absoluta; deben evaluarse la disponibilidad y la validación del ensayo.
Conozca el enfoque
¿Es correcta la identificación morfológica?
El nivel de identificación posible depende de la calidad de la muestra, del marcador y de las referencias disponibles.
Conozca el enfoque
¿Cuál es la diversidad genética de la población de origen para una reintroducción?
La conectividad genética no mide directamente el desplazamiento actual de los individuos. Las inferencias dependen de la escala temporal, del muestreo y de los marcadores; una asociación no demuestra causalidad por sí sola.
Conozca el enfoque
El alcance, la curación y los controles dependen de los datos y metadatos disponibles. La resolución taxonómica depende de la calidad de las secuencias y de las referencias.
Conozca el enfoqueCuéntenos el contexto del proyecto, el entorno y la pregunta que necesita responder. La conversación inicial ayuda a definir el enfoque y el alcance.